博奥晶典高分辨率空间转录组平台

博奥晶典高分辨率空间转录组使用原位捕获和条形码技术，在亚细胞分辨率（探针簇直径0.8 μm，相邻簇中心距离1.4 μm）下获取整个冷冻组织切片中的转录组图谱，可以在单细胞分辨率水平上研究细胞间的相互作用。目前，该产品兼容冰冻组织（OCT 包埋FF 组织），适用于所有动植物样本。

1、 表达芯片特征

图1 博奥晶典高分辨率空间表达芯片示意图

芯片包括两种类型：组织透化芯片和基因表达芯片，表达芯片捕获区域面积为11*11mm。在捕获区域内存在着数千万的探针簇，每个探针簇的直径为0.8 μm，每平方微米有约18000 条探针，用于捕获转录本（图1）。每条探针捕获序列由5 部分组成 ：

1、P7 和Seq primer：部分测序引物序列；

2、空间Barcode 序列；

3、固定序列：57 nt；

4、UMI 序列；

5、30nt poly（dT) 序列用于捕获转录本；

2、 表达芯片特征

图 2 博奥晶典高分辨率空间转录组实验流程

由于不同物种、组织来源的样本所需的最佳透化时间不尽相同，在空间转录组测序实验前，首先要进行组织优化。确定好透化条件后，即可进行空间转录组文库构建及测序分析流程。

3、 送样要求

可以参考《博奥晶典10x FF 冰冻组织空间转录组样品制备及运输指南》进行样本制备及送样；要求 RNA 的 RIN 值大于7 的样本用于正式实验。

4、 数据表现

图3 小鼠肾组织空间转录分群映射图

使用博奥晶典高分辨率空间转录组平台， 构建了小鼠肾的高分辨率空间转录组图谱，揭示了肾组织空间分区结构（图3）。其次，小鼠肾基因表达图谱与HE 染色结果相结合可以清晰的了解各细胞类群的基因表达及相互作用，揭示它们对疾病发生、发展、治疗、预后评估的价值。

图4 小鼠肾组织空间转录分群映射图

目前对人和小鼠的多种组织，包括嗅球、小肠、肾脏、肝等进行空间转录实验，绘制各种细胞类型在组织中的精细空间分布（图4）。

5、 平台优势

亚细胞分辨率：分辨率为1.4 μm，提供高精度的亚细胞空间定位；

单细胞时空组学完整解决方案：结合病理空间信息和单细胞分辨率，与单细胞和Xenium亚细胞空间原位平台联合，从单细胞、空间以及原位高精度解析组织生物学特征；

高捕获效率及高通量基因检测：超高密度探针，实现切片组织上捕获更多的转录本信息，对于新转录本和低表达丰度的检测提供优势；

多分辨率分析：支持5-100 μm 分辨率数据分析；