GemCode 您听说过么？
GemCode 是10X Genomics公司推出的一款大片段 DNA 建库分析平台。2015年成为十大生命科学领域创新产品评选排名第一的产品，博奥生物集团旗下子公司博奥晶典是首家引进此平台的公司！
为什么要发明GemCode？
检测大片段DNA的改变、减少基因组组装的gap，之前主要靠第三代测序（例如PacBio）完成，但实验成本非常高。为了能够经济快速地产生数据，实 现SNP的大规模鉴定，研究人员不断寻找新的工具。终于2015年2月，10X Genomics公司发布的GemCode大片段建库平台顺势而生。与Pacbio三代测序原理不同的是，该平台通过对大片段引入序列标识的方法，能够间 接实现长片段测序。这个平台并非单独使用，而是与短读取的测序仪结合使用，能轻松整合到现有的测序流程中。该平台最流弊的是只需低至1ng 的DNA就能完成建库和测序实验，完成长达几十Mb的单体型序列分析，是疾病遗传学研究、动植物育种研究、基础生物学研究等强有力的工具。
神奇GemCode的工作原理？
GemCode使用的是胶珠微滴扩增系统，微滴由GemCode仪器产生，每个微滴中包含约60个长链模板DNA分子（>100kb）、1个胶珠 以及DNA扩增所需的聚合酶、dNTP等。扩增的引物固定于胶珠内，每个微珠内的引物含有一种特定序列14bp barcode标签（多达70万种）和illumina测序所需的序列。PCR扩增反应在微滴内进行，来自于一个微滴的长链模板产生的扩增产物带有能识别 该微滴的特定标签序列；而不同胶珠内的barcode标签不同，从而追踪发生在各微滴的扩增反应。扩增产物用于后续illumina建库和测序，通过 barcode序列信息追踪来自每个大片段DNA模板的多个读段，从而进行单体型拼接和结构变异分析。
